Rt pcr что это значит
ПЦР с обратной транскрипцией
В молекулярной биологии метод полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (англ. reverse transcription polymerase chain reaction ) принято обозначать как ОТ-ПЦР (англ. RT-PCR ). ОТ-ПЦР представляет собой метод амплификации специфического фрагмента рибонуклеиновой кислоты (РНК). [1]
Одноцепочечную молекулу РНК превращают в реакции обратной транскрипции (ОТ, англ. RT, reverse transcription ) в комплементарную ДНК (cDNA) и далее амплифицируют уже одноцепочечную молекулу ДНК, используя традиционную ПЦР. RT-PCR не следует путать с ПЦР в реальном времени (англ. Real-time PCR, Q-PCR ), которую также иногда неверно сокращают как RT-PCR. [2]
Содержание
Описание метода
Для превращения последовательности РНК в комплементарную ДНК используют обратную транскриптазу:
После 30 циклов амплификации образуются миллионы копий нужной последовательности. [2]
Применение
ОТ-ПЦР обычно используется при изучении вируса иммунодефицита человека, так как ВИЧ является ретровирусом и поэтому использует фермент обратную транскриптазу ВИЧ (англ. HIV-Reverse Transcriptase ) для синтеза вирусной ДНК, которая затем встраивается в геном хозяина.
Примечания
Литература
См. также
Полезное
Смотреть что такое «ПЦР с обратной транскрипцией» в других словарях:
ПЦР — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Полимеразная цепная реакция — (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой кислоты (ДНК) в биологическом материале (пробе). Помимо амплификации ДНК, ПЦР… … Википедия
Полимеразная цепная — Запрос «ПЦР» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Полимеразная цепная реакция (ПЦР) экспериментальный метод молекулярной биологии, позволяющий добиться значительного увеличения малых концентраций определённых фрагментов нуклеиновой… … Википедия
Хронический миелобластный лейкоз — Филадельфийская хромосома, флюоресцентная гибридизация in situ … Википедия
Обратная транскрипция — Обратная транскрипция это процесс образования двуцепочечной ДНК на матрице одноцепочечной РНК. Данный процесс называется обратной транскрипцией, так как передача генетической информации при этом происходит в «обратном», относительно… … Википедия
Клинические стадии ВИЧ/СПИДа по В.И. Покровскому — Запрос «СПИД» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Синдром приобретённого иммунного дефицита Красная ленточка символ солидарности с ВИЧ положительными и пациентами, у которых развился СПИД МКБ 10 B … Википедия
Обратная транскриптаза ВИЧ — Обратная транскрипция это процесс образования двуцепочечной ДНК на матрице одноцепочечной РНК. Данный процесс называется обратной транскрипцией, так передача генетической информации при этом происходит в «обратном» направлении, относительно… … Википедия
СПИД — Запрос «СПИД» перенаправляется сюда. Cм. также другие значения. Синдром приобретённого иммунного дефицита Красная ленточка символ солидарности с ВИЧ положительными и пациентами, у которых развился СПИД МКБ 10 B … Википедия
ПЦР (RT-PCR) тесты на коронавирус Covid-19. Как подготовиться к тестированию?
Статья размещена: 23 Октября 2021
Последнее изменение: 02 Сентября 2020
Тест ПЦР на КОВИД: симптомы, признаки и подробности о вирусе
Коронавирусная инфекция в своей основе содержит РНК вирусы. На молекулярном уровне вирус по форме выглядит как корона, откуда и произошло его название. Covid-19 представлен острой респираторной инфекцией, которая характеризуется симптоматикой и клинической картиной гриппа.
Почти все респираторные болезни отличаются схожими симптомами:
Коронавирусная инфекция отличается тем, что она быстро вызывает пневмонию. Это тяжелые осложнения, которые могут закончиться летальным исходом. Нужно своевременно распознать пневмонию и предоставить человеку срочную медицинскую помощь.
Если симптомы респираторной инфекции развиваются после контакта с зараженным человеком, нужно срочно сдать анализ ПЦР. Примечательно, что от инфицирования до появления симптомов проходит 5-7 дней. Это инкубационный период, который никак не проявляется. При коронавирусе он продолжается 14 дней.
Как правило, covid-19 передается воздушно-капельным путём. Но подхватить вирус можно, случайно ухватившись рукой за зараженную поверхность. Нужно соблюдать меры предосторожности, рекомендуемые ВОЗ (они разрабатывались в марте 2020 года как профилактика дальнейшего распространения пандемии):
Вирус передается через слизистые оболочки тела: например, если потереть глаза рукой, на которой появился патогенный микроорганизм, риск заражения повышается до критического уровня. Рекомендуется применять защиту для рук и лица одновременно.
Сам тест ПЦР был изобретён в 1983 году. на данный момент это один из основных типов работы с биоматериалами, которые активно применяются в самых разных областях деятельности: генетика, криминалистика, медицина. Автор этого способа тестирования в свое время получил Нобелевскую премию за представленное изобретение.
Работа с РНК и ДНК в рамках полимеразной цепной реакции позволяет выявить серьёзные вирусные инфекции. В частности, это туберкулез, ВИЧ-инфекция, энцефалиты и другие патологии, которые способны вызывать осложнения, а в запущенных случаях часто приводят к смерти.
Сейчас в мире разрабатывается огромное количество тестов, которые направлены на выявление возбудителей коронавируса на зародышевой стадии. Но самой надёжной методикой по-прежнему остается ПЦР диагностика, проводимая в лабораторных условиях с соблюдением международных медицинских стандартов.
Когда потребуется сделать тест RT-PCR на Covid-19?
Сдать тест на коронавирус в поликлинике человеку потребуется в следующих ситуациях:
Метод ПЦР тестирования позволяет выявить РНК вирусного возбудителя, трансформировать его в ДНК на основании взятых у человека мазков. Посредством представленных действий можно установить, заражен ли человек патогеном на данный момент.
Где пройти тест ПЦР в России?
Пройти тестирование на коронавирус можно в нашей клинике. Исследование проводится лабораторно, посредством забора биоматериала на анализ. Это не инвазивная процедура, она совершенно безболезненная. Подходит взрослым и детям.
Важно соблюдать рекомендации врачей:
Анализ ПЦР лучше сдавать утром. Перед обращением обязательно свяжитесь с нашими консультантами и уточните все подробности.
Желательно не сдавать тест, если у вас пока не наблюдается симптомов гриппа. В таком случае методика будет малоэффективной. Отсутствие респираторных симптомов значит, что вирус ещё не добрался да эпителиальных тканей. Результат может оказаться ошибочно отрицательным.
С другой стороны, сделать ПЦР диагностику критически важно, если наблюдаются признаки пневмонии.
Как проводится платный тест RT-PCR?
Выявление патогенного возбудителя проводится в лабораторных условиях. Из полученных мазков специалист выделяет одноцепочечную РНК. Далее осуществляется моделирование на базе полученной РНК двуцепочной ДНК.
Затем полученные данные неоднократно дублируются посредством полимеразы, которая является специфическим ферментом. Таким образом, производится амплификация. Этот инструмент современной биологии используется, чтобы обнаружить даже минимальные количества возбудителя.
Соответственно, концентрация нужных видов элементов ДНК и РНК становится больше. В рамках исследования делают дубли только одного определенного участка с вирусной нагрузкой.
Платные тесты на коронавирус предполагают работу только с биоматериалом, взятым с эпителия пациента. Исследование других биологических жидкостей или кала даст результаты только на более поздних стадиях заболевания. ПЦР диагностика является первой в мире по точности, поскольку она основана на изучении молекулярной структуры вируса.
Рекомендуется делать повторные тесты. Дело в том, что полученные результаты иногда могут быть ложноотрицательными. Также некоторые пациенты в силу своей профессии вынуждены контактировать с огромным количеством людей. Соответственно, им необходимо периодически проверяться. Имеют значение и контрольные исследования, которые назначаются после лечения от коронавируса.
Экспресс тест RT-PCR. Когда потребуется быстрое тестирование?
Наиболее распространенными в России являются экспресс-тесты и система ПЦР диагностики. На предварительных этапах всегда используются быстрые тесты. Они недорогие в цене, показывают результаты всего за 10 минут и продаются в любой аптеке.
Экспресс-тестирование активно используется в следующих местах:
Провести экспресс тест на КОВИД можно самостоятельно. В целях избежания ошибок желательно повторить тест хотя бы два раза. При необходимости за услугой можно обратиться в клинику, процедура проводится квалифицированным врачом.
Экспресс и ПЦР тест на коронавирус: цена
Как мы уже говорили выше, приобрести экспресс-тест можно практически в любой аптеке. Цена таких тестов составляет примерно 500-1000 руб.
Цена теста ПЦР на коронавирус будет более высокой. Она составляет примерно 5000 руб. Учитывая, что такой тест проводится в лабораторных условиях и с применением труда квалифицированных работников лаборатории, его стоимость не может быть низкой.
Если вы хотите уточнить конкретную стоимость ПЦР диагностики, Можно связаться с нашими консультантами по указанному номеру телефона. Специалист подробно расскажет, что нужно будет сделать, как подготовиться к тестированию. Также он поможет подсчитать более точную цену процедуры, проинформирует насчет сроков подготовки результатов теста.
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией
Обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции ( ОТ-ПЦР ) является лабораторная методика комбинирования обратной транскрипции из РНК в ДНК (в этом контексте называется комплементарной ДНК или кДНК) и амплификации специфических мишеней ДНК с использованием полимеразной цепной реакции (ПЦР). [1] Он в основном используется для измерения количества конкретной РНК. Это достигается путем мониторинга реакции амплификации с помощью флуоресценции, метода, называемого ПЦР в реальном времени или количественной ПЦР (qPCR). Комбинированная ОТ-ПЦР и КПЦР обычно используются для анализа экспрессии генов. и количественная оценка вирусной РНК в исследованиях и клинических условиях.
СОДЕРЖАНИЕ
Номенклатура [ править ]
Комбинированный метод ОТ-ПЦР и КПЦР был описан как количественная ОТ-ПЦР [3] или ОТ-ПЦР в реальном времени [4] (иногда даже называемая количественной ОТ-ПЦР в реальном времени [5] ). qRT-PCR, [6] RT-qPCR, [7] RRT-PCR, [8] и rRT-PCR. [9] Во избежание путаницы в этой статье будут последовательно использоваться следующие сокращения:
Техника | Сокращение |
---|---|
Полимеразной цепной реакции | ПЦР |
Полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией | ОТ-ПЦР |
Полимеразная цепная реакция в реальном времени | КПЦР |
Комбинированный метод RT-PCR / qPCR | qRT-PCR |
Не все авторы, особенно более ранние, используют это соглашение, и читатель должен быть осторожен при переходе по ссылкам. ОТ-ПЦР использовалась для обозначения как ПЦР в реальном времени (qPCR), так и ПЦР с обратной транскрипцией (RT-PCR).
История [ править ]
С момента своего появления в 1977 году Нозерн-блот широко использовался для количественной оценки РНК, несмотря на его недостатки: (а) метод, требующий больших затрат времени, (б) требующий большого количества РНК для обнаружения, и (в) количественно неточный из-за низкой распространенности Содержание РНК. [10] [11] Однако с момента своего изобретения Кэри Муллис в 1983 году ОТ ПЦР с тех пор вытеснила Нозерн-блоттинг как метод выбора для обнаружения и количественной оценки РНК. [12]
Принципы [ править ]
В ОТ-ПЦР матрицу РНК сначала преобразуют в комплементарную ДНК (кДНК) с помощью обратной транскриптазы (ОТ). Затем кДНК используют в качестве матрицы для экспоненциальной амплификации с помощью ПЦР. QT- NASBA в настоящее время является наиболее чувствительным методом обнаружения РНК. [16] [ нерелевантная цитата ] Использование ОТ-ПЦР для обнаружения РНК-транскрипта произвело революцию в изучении экспрессии генов в следующих важных направлениях:
Одноэтапная ОТ-ПЦР против двухэтапной ОТ-ПЦР [ править ]
Конечная ОТ-ПЦР против ОТ-ПЦР в реальном времени [ править ]
Количественный анализ продуктов ОТ-ПЦР в основном можно разделить на две категории: конечная точка и анализ в реальном времени. [16] Использование конечной точки ОТ-ПЦР является предпочтительным для измерения изменений экспрессии генов в небольшом количестве образцов, но ОТ-ПЦР в реальном времени стала золотым стандартом для проверки количественных результатов, полученных в результате анализа массивов или экспрессии генов. изменения в глобальном масштабе. [23]
Конечная ОТ-ПЦР [ править ]
Относительная ОТ-ПЦР Относительная количественная оценка RT-PCR включает коамплификацию внутреннего контроля одновременно с интересующим геном. Внутренний контроль используется для нормализации образцов. После нормализации можно провести прямое сравнение относительного содержания транскриптов в нескольких образцах мРНК. Следует отметить одну меру предосторожности: внутренний контроль должен быть выбран таким образом, чтобы экспериментальное лечение не влияло на него. Уровень экспрессии должен быть постоянным во всех образцах и с учетом интересующей мРНК, чтобы результаты были точными и значимыми. Поскольку количественная оценка результатов анализируется путем сравнения линейного диапазона целевой и контрольной амплификации, крайне важно принять во внимание исходную концентрацию целевых молекул и скорость их амплификации до начала анализа.Результаты анализа выражаются в виде отношения сигнала гена к сигналу внутреннего контроля, значения которого затем можно использовать для сравнения между образцами при оценке относительной экспрессии целевой РНК. [25] [28] [29] Конкурентная ОТ-ПЦР Для абсолютной количественной оценки используется метод конкурентной ОТ-ПЦР. Он включает использование синтетической «конкурентной» РНК, которую можно отличить от целевой РНК по небольшой разнице в размере или последовательности. Для создания синтетической РНК важно быть идентичной по последовательности, но немного короче целевой РНК для получения точных результатов. После конструирования и синтеза известное количество конкурирующей РНК добавляется к экспериментальным образцам и коамплифицируется с мишенью с помощью ОТ-ПЦР. Затем строят кривую концентрации конкурентной РНК, и ее используют для сравнения сигналов ОТ-ПЦР, полученных от эндогенных транскриптов, для определения количества мишени, присутствующей в образце. [28] [30] Сравнительная ОТ-ПЦР Сравнительная ОТ-ПЦР аналогична конкурентной ОТ-ПЦР в том, что РНК-мишень конкурирует за реагенты для амплификации в рамках одной реакции с внутренним стандартом неродственной последовательности. После завершения реакции результаты сравниваются с кривой внешнего стандарта для определения целевой концентрации РНК. По сравнению с относительными и конкурентными методами количественной оценки сравнительная ОТ-ПЦР считается более удобным методом для использования, поскольку не требует от исследователя проведения пилотного эксперимента; в относительной ОТ-ПЦР должен быть заранее определен диапазон экспоненциальной амплификации мРНК, а при конкурентной ОТ-ПЦР должна быть синтезирована синтетическая конкурирующая РНК. [28] [31] [32] [33] [34]
ОТ-ПЦР в реальном времени [ править ]
SYBR Зеленый Когда SYBR Green связывается с двухцепочечной ДНК продуктов ПЦР, он будет излучать свет при возбуждении. Интенсивность флуоресценции увеличивается по мере накопления продуктов ПЦР. Этот метод прост в использовании, так как создание зондов не требуется из-за отсутствия специфичности их связывания. Однако, поскольку краситель не отличает двухцепочечную ДНК от продуктов ПЦР и от димеров праймеров, переоценка целевой концентрации является обычной проблемой. Если точная количественная оценка является абсолютной необходимостью, необходимо провести дальнейший анализ для подтверждения результатов. Тем не менее, среди методов обнаружения продуктов ОТ-ПЦР в реальном времени SYBR Green является наиболее экономичным и простым в использовании. [16] [23]
Для количественной оценки результатов, полученных с помощью ОТ-ПЦР в реальном времени, обычно используются две стратегии; метод стандартной кривой и метод сравнительного порога. [40]
Заявление [ править ]
Методы исследования [ править ]
ОТ-ПЦР обычно используется в исследовательских методах для измерения экспрессии генов. Например, Lin et al. использовали qRT-PCR для измерения экспрессии генов Gal в дрожжевых клетках. Во-первых, Lin et al. сконструировали мутацию белка, предположительно участвующего в регуляции генов Gal. Предполагается, что эта мутация избирательно подавляет экспрессию Gal. Чтобы подтвердить это, уровни экспрессии генов дрожжевых клеток, содержащих эту мутацию, анализировали с помощью qRT-PCR. Исследователи смогли окончательно определить, что мутация этого регуляторного белка снижает экспрессию Gal. [41] Нозерн-блоттинг используется для дальнейшего изучения экспрессии генов РНК.
Вставка гена [ править ]
Диагностика генетических заболеваний [ править ]
Обнаружение рака [ править ]
Ученые работают над способами использования ОТ-ПЦР при обнаружении рака, чтобы улучшить прогноз и контролировать реакцию на терапию. Циркулирующие опухолевые клетки продуцируют уникальные транскрипты мРНК в зависимости от типа рака. Цель состоит в том, чтобы определить, какие транскрипты мРНК служат лучшими биомаркерами для определенного типа раковых клеток, а затем проанализировать уровни их экспрессии с помощью ОТ-ПЦР. [43]
Проблемы [ править ]
Несмотря на свои основные преимущества, ОТ-ПЦР не лишена недостатков. Экспоненциальный рост обратно транскрибируемой комплементарной ДНК (кДНК) во время нескольких циклов ПЦР приводит к неточному количественному определению конечной точки из-за трудности поддержания линейности. [45] Чтобы обеспечить точное обнаружение и количественную оценку содержания РНК в образце, была разработана qRT-PCR с использованием модификации на основе флуоресценции для мониторинга продуктов амплификации во время каждого цикла PCR. Чрезвычайная чувствительность метода может быть обоюдоострым мечом, поскольку даже малейшее загрязнение ДНК может привести к нежелательным результатам. [46] Простым методом устранения ложноположительных результатов является добавление якорей или тегов.к 5′-области специфичного для гена праймера. [47] Кроме того, планирование и разработка количественных исследований может быть технически сложной задачей из-за существования многочисленных источников вариаций, включая концентрацию матрицы и эффективность амплификации. [31] Добавление известного количества РНК в образец, добавление серии разведений РНК, создающих стандартную кривую, и добавление образца без копий шаблона (без кДНК) могут использоваться в качестве контроля.
Протокол [ править ]
ОТ-ПЦР может быть проведена с использованием протокола одноэтапной ОТ-ПЦР или двухэтапного протокола ОТ-ПЦР.
Одноэтапная ОТ-ПЦР [ править ]
В одну стадию ОТ-ПЦР берут мишени мРНК (до 6 т.п.н.) и подвергают их обратной транскрипции, а затем амплификации ПЦР в одной пробирке. Для достижения наилучших результатов используйте только неповрежденную РНК высокого качества. Обязательно используйте праймер, специфичный для последовательности.
(Руководство по применению ПЦР и биологические инструменты)
Двухэтапная ОТ-ПЦР [ править ]
Двухэтапная ОТ-ПЦР, как следует из названия, происходит в два этапа. Сначала обратная транскрипция, а затем ПЦР. Этот метод более чувствителен, чем одношаговый. Наборы также можно использовать для двухэтапной ОТ-ПЦР. Как и в случае одноэтапной процедуры, для достижения наилучших результатов используйте только интактную РНК высокого качества. Праймер для двухэтапной обработки не обязательно должен быть специфичным для последовательности.
Шаг первый [ править ]
Шаг второй [ править ]
Правила публикации [ править ]
Количественный анализ ОТ-ПЦР считается золотым стандартом для измерения количества копий конкретных кДНК-мишеней в образце, но он плохо стандартизован. [51] В результате, несмотря на то, что существует множество публикаций, использующих этот метод, во многих из них приводятся неадекватные экспериментальные детали и используется неподходящий анализ данных, чтобы сделать неправильные выводы. Из-за присущей изменчивости качества любых количественных данных ПЦР не только рецензентам трудно оценивать эти рукописи, но также становится невозможным воспроизвести исследования. [52] Признавая необходимость стандартизации отчетов об условиях экспериментов, Минимум информации для публикации количественных экспериментов ПЦР в реальном времени.(MIQE, произносится как mykee) рекомендации были опубликованы международным консорциумом академических ученых. В рекомендациях MIQE описывается минимум информации, необходимой для оценки количественных экспериментов ПЦР, которая должна потребоваться для публикации для поощрения лучшей экспериментальной практики и обеспечения актуальности, точности, правильной интерпретации и повторяемости количественных данных ПЦР. [53]
Руководство состоит из следующих элементов: 1) план эксперимента, 2) образец, 3) экстракция нуклеиновой кислоты, 4) обратная транскрипция, 5) информация о мишени кПЦР, 6) олигонуклеотиды, 7) протокол, 8) проверка и 9) данные. анализ. Конкретные элементы в каждом элементе имеют метку E (обязательно) или D (желательно). Те, которые помечены E, считаются критическими и незаменимыми, в то время как помеченные D считаются второстепенными, но важными для лучших практик. [53]
Вникаем: complementary DNA strand (кейс из медперевода)
— Женя, я предлагаю переводить «a complementary DNA strand» как «нить комплементарной ДНК».
— А почему именно так, а не, например, «комплементарная нить ДНК»? Надо вникнуть.
— Не уверена, но ты прав, надо вникнуть.
Мы с переводчицей, Галиной Куркиной, разбирали глоссарий для руководства по онкологии, и вся фраза звучала так:
The first step of the RT-PCR reaction is to copy the mRNA strand into a complementary DNA strand (cDNA strand).
Поскольку глава относилась к молекулярной биологии опухолей, нужно было копнуть именно эту область.
Первым делом, я попробовал разобраться в том, что такое RT-PCR.
Об этом термине мы поговорим чуть позже, а сначала разберемся с PCR.
PCR, polymerase chain reaction, полимеразная цепная реакция — весьма широко используется там, где нужно сделать из одного образца (фрагмента) ДНК много таких же.
Примеров применения масса:
— секвенирование ДНК;
— тест на отцовство;
— проверка на наличие вируса (в т. ч. и вездесущего COVID-19);
— клонирование генов;
— выявление генных нарушений.
Вероятно, именно из-за последнего пункта эта реакция и попала в руководство по онкологии.
Описана эта реакция была довольно давно — в 1985 году, а изобретатель — американский химик-синтетик, позднее биохимик, Кари Маллис — через 8 лет, в 1993 году, получил за нее Нобелевскую премию.
Тогда же, в 1985 году, ему идея этой реакции показалась настолько красивой, что он сам себя отговаривал ее развивать: «Не может быть, чтобы такая простая идея не приходила никому в голову. Хотя, может и нет никакой идеи, просто тут где-то ошибка, которую я не вижу?»
Для реакции понадобятся:
Логика реакции была такая:
Операция повторялась много раз, концентрация нужного участка ДНК (гена) после каждой операции увеличивалась, т.к. праймеры с каждым разом помогали отрезать от получавшихся нитей все лишнее, в итоге нужный ген многократно, я бы даже сказал, многотысячекратно увеличивался.
Нужно отметить, что поначалу первые ДНК-полимеразы от каждого повторного нагрева разрушались, и при каждом цикле надо было добавлять новые ДНК-полимеразы. Однако, потом ученые научились их извлекать из термофильных бактерий Thermus aquaticus (которые живут в гейзерах) — их ДНК-полимераза названа Taq-полимеразой. Не без гордости отмечу, что свойства этих бактерий были описаны советскими учеными в 1980 году.
Ну так вот — наличие этой полимеразы сильно облегчило жизнь ученым — после каждого кипячения добавлять ДНК-полимеразу уже не требовалось.
Итак, в первом приближении с реакцией ПЦР мы разобрались, но как вы помните, у нас на входе был другой термин — RT-PCR что означает reverse transcription PCR или «ПЦР с обратной транскрипцией». Иногда, кстати, это же сокращение — RT-PCR — используется для другой реакции — real time PCR, «полимеразная цепная реакция в реальном времени» — но там немного другая опера.
RT-PCR
Дело в том, что не всегда есть возможность получить из образцов чистую ДНК, однако есть возможность получить РНК (ДНК живет в ядре клетки, а РНК обычно в цитоплазме).
Эта реакция позволяет получать ДНК из РНК — чтобы потом делать с ДНК уже реакцию PCR (описанную выше). Собственно, она потому и называется reverse — т. к. мы здесь поворачиваем вспять обычную биологическую реакцию — из ДНК в РНК.
Итак, порядок действий такой.
Отмечу, что РНК намного менее стабильный полимер, нежели ДНК, и с ней чаще происходят неточности копирования, отчасти поэтому репликацию делают именно из ДНК, а не РНК.
Так вот, вернемся к нашим баранам, а точнее к предложению, с которого все началось.
The first step of the RT-PCR reaction is to copy the mRNA strand into a complementary DNA strand (cDNA strand).
Здесь уже становится очевидно, что речь идет о комплементарной нити ДНК — т.е. о нити, которая комплементарна образцовой мРНК. Задачка решена.
P.S. Отмечу, что в биохимии я чайник, а потому мой текст кишит неточностями и, что уж греха таить, ошибками — за что прошу специалистов сильно меня сапогами не пинать :).
На иллюстрациях схемы реакций, ну и — для пользы дела и коллег переводчиков — английские термины.
С уважением,
Евгений Бартов,
главред и руководитель бюро.
Иллюстратор: Галина Таранова, контент-менеджер, маркетолог бюро переводов «Альянс ПРО»