Sneathia spp leptotrichia spp fusobacterium spp что это

Исследование биоценоза урогенитального тракта Фемофлор-16 (определение ДНК) (16 показателей + КВМ)

Что такое Фемофлор?

Дисбаланс микробиоты урогенитального тракта женщин, обусловленный условно-патогенными микроорганизмами, характеризуется изменением качественного и/или количественного состава нормобиоты, метаболическими и иммунными нарушениями, в ряде случаев клиническими проявлениями. Частным проявлением выраженного дисбаланса биоты является бактериальный вагиноз.

Полное выявление этиологической структуры заболевания позволит своевременно установить диагноз, выявить осложненные формы течения заболевания и, соответственно, провести направленную адекватную терапию, в том числе на ранней стадии, до развития осложнений.

В основу метода положена комплексная количественная оценка биоты методом ПЦР в «реальном времени» (РВ). Проводят сравнение количества конкретных представителей нормо – и условно-патогенной биоты с общим количеством микроорганизмов с целью выявления дисбаланса биоты, степени его выраженности и определения этиологической роли конкретных микроорганизмов в его развитии при условии контроля качества получения клинического образца для исследования.

Способ позволяет в короткие сроки объективно оценить:

Показатели, анализируемые с помощью набора Фемофлор 16:

Контроль взятия материала (КВМ).

Необходимым условием количественного анализа урогенитальной биоты является правильная техника взятия соскоба с поверхности соответствующего биотопа (уретра, цервикальный канал, влагалище). Показателем правильного взятия биоматериала является достаточное количество геномной ДНК человека в пробе. Источником этой ДНК являются эпителиальные клетки, попадающие в пробу при правильной технике взятия биоматериала. Оптимальная величина этого показателя должна составлять не менее 105.

Показатель оценивается в абсолютных значениях.

Общая бактериальная масса (ОБМ).

Показатель, по которому можно судить об общем количестве бактерий. Оценивается в абсолютных значениях. Обычно эта величина составляет 106 – 108. Величина ОБМ большая, чем 108, свидетельствует об избыточном микробном обсеменении биоматериала. Чем больше величина ОБМ, тем больше величина микробной массы в образце. Величина показателя ОБМ меньшая, чем 105 соответствует сниженному количеству микроорганизмов в образце, что может быть следствием атрофических процессов или антибиотикотерапии.

Оценка нормобиоты.

Главным представителем нормофлоры урогенитального тракта у женщин репродуктивного возраста являются представители рода Lactobacillus (ЛБ).

Оценка нормобиоты производится как в абсолютных значениях, так и относительно общей бактериальной массы. В норме абсолютное количество лактобацилл практически не отличается от общего количества бактерий, то есть составляет 106–108

Относительное количество лактобацилл – разница между Lg10 общей бактериальной массы (ОБМ) и Lg10 лактобацилл (ЛБ). Например, если общее количество бактерий составляет 107, Lg10 этого количества будет равен 7. В норме разница логарифмов (порядков) ОБМ и ЛБ не должна превышать 0,5, что определяется погрешностью метода.

Умеренно сниженный уровень лактобацилл – при разнице логарифмов (порядков) от 0,5 до 1.

Значительно сниженный уровень лактобацилл–при разнице логарифмов (порядков) больше чем 1.

Чем меньшую долю в ОБМ составляют лактобациллы, тем сильнее угнетена нормальная флора.

Оценка аэробной и анаэробной условно-патогенной микрофлоры.

Количественный уровень аэробной и анаэробной условно-патогенной микрофлоры можно оценить как в абсолютных, так и относительных значениях. Абсолютные количества соответствуют показателям при бактериологичесих исследованиях. Например, количество микроорганизма Gardnerella vaginalis составляет 103.

Относительное количество того или иного микроорганизма вычисляется по отношению к количеству Lactobacillus spp., по разнице между Lg10 лактобацилл и Lg10 конкретного микроорганизма аналогично тому, как вычисляется относительное количество самих лактобацилл по отношению к общему количеству бактерий (ОБМ).

В урогенитальном тракте женщин репродуктивного возраста как аэробные, так и анаэробные условно-патогенные микроорганизмы могут быть причиной патологических процессов в урогенитальном тракте.

Оценка микоплазм, уреаплазм и грибов рода Candida.

Показания к назначению анализа

Материал для исследования

Для исследования используют соскобы эпителиальных клеток

Критерии количественной оценки биоты

Абсолютный показатель является ориентировочным, зависит от техники взятия биоматериала и способа выделения ДНК.

Нормоценоз

Состояние нормоценоза характеризуется следующими показателями:

Умеренный дисбиоз

Выраженный дисбиоз.

Состояние выраженного дисбиоза характеризуется следующими показателями:

Этиологическая структура выявленного дисбаланса:

Анаэробный, если дисбаланс вызван анаэробными микроорганизмами: Gardnerella vaginalis /Prevotella bivia/Porphyromonas spp; Atopobium vaginae; Eubacterium spp; Sneathia spp /Leptotrihia spp/Fusobacterium spp; Megasphera spp/Veilonella spp/Dialister spp; Lachnobacterium spp/Clostridium spp; Mobiluncus spp/Corynebacterium spp; Peptostreptococcus spp

Аэробный, если дисбаланс, вызван аэробной микрофлорой: Enterobacteraceae, Streptococcus spp и Staphylococcus spp

Смешанный если дисбаланс, вызван любым сочетанием аэробной, анаэробной флоры и грибами рода Candida.

Инфекционный процесс, вызванный грибами рода Candida, может протекать без дисбиотических нарушений со стороны условно-патогенной флоры, а также может сочетаться с дисбиозом.

Источник

Лечение урогенитальных инфекций

Записаться к врачу

+7 (812) 953-97-00

Урогенитальные инфекции ИППП – это бактерии и вирусы, которые при попадании в половые пути могут привести к неприятным симптомам, таким как: Урогенитальные инфекции

Возбудителями инфекционного процесса являются различные группы микроорганизмов, как патогенные — пагубно влияющие на организм, вызывающие опасные заболевания, так и условно — патогенные формы, которые вредят организму только в определенных условиях.

Заражение урогенитальными инфекциями происходит только половым путем: вагинальным, анальным, генитально-оральным. Таким образом урогенитальные инфекции могут быть обнаружены как во влагалище — у женщин, в мочеиспускательном канале — у мужчин, так и в прямой кишке и ротовой полости у обоих полов.

ВАЖНО!! УВАЖАЕМЫЕ ПАЦИЕНТЫ — УРОГЕНИТАЛЬНЫЕ (ПОЛОВЫЕ) ИНФЕКЦИИ НЕ ЛЕЧАТСЯ ОДНОЙ ВОЛШЕБНОЙ ТАБЛЕТКОЙ ИЛИ СВЕЧКОЙ ОТ ВСЕХ ИНФЕКЦИЙ, ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ КАЖДОЙ ИНФЕКЦИИ СУЩЕСТВУЕТ СВОЙ ПРЕПАРАТ, ДОЗИРОВКА КОТОРОГО НАЗНАЧАЕТСЯ ВРАЧОМ ИСХОДЯ ИЗ ДАВНОСТИ И СТЕПЕНИ ЗАРАЖЕНИЯ

ИППП — инфекции передающиеся половым путем требуют срочного лечения у врача венеролога. Самолечение сбивает симптоматику и переводит инфекцию в хроническую форму, которую в последствие трудно будет вылечить.

Условно — патогенные микроорганизмы — не так безобидны как могут казаться. При определенных факторах: стрессы, недосыпы, переутомляемость, снижение иммунитета — условно-патогенные микроорганизмы начинают усиленно размножаться и вызывать заболевания репродуктивных органов.

Урогенитальные инфекции последствия:

Профилактика урогенитальных инфекций урогенитальные инфекции

Для того, чтобы избежать присоединения инфекции следует соблюдать несложные правила:

Источник

Фемофлор

Фемофлор — это скрининговое исследование микрофлоры урогенитального тракта у женщин методом ПЦР (в режиме Real-time реального времени).

Фемофлор назначают при:

Вагинальная микрофлора

Причины и факторы нарушения вагинального биоценоза

Показания и противопоказания к применению метода

Способ позволяет в короткие сроки объективно:

С помощью данного метода определяются следующие показатели:

Варианты комплектации «ФЕМОФЛОР»

Правила подготовки к исследованию «ФЕМОФЛОР»

Забор урогенитального материала у детей до 18 лет, беременных, девственниц осуществляет врач гинеколог (приносной материал).

Источник

Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Кожа») в Москве

Анализ микробиоты кожи по Осипову позволяет выявить состав микроорганизмов, обитающих на коже человека. В основе метода лежит хромато-масс-спектрометрия.
Благодаря данному анализу специалист может определить, какая флора преобладает на коже пациента, обнаружить дисбаланс и назначить подходящую терапию, чтобы восстановить равновесие.

Приём и исследование биоматериала

Когда нужно сдавать анализ Анализ микробиоты по Осипову (биотоп «Кожа»)?

Подробное описание исследования

Микробиоценоз поверхности кожи, или совокупность популяций разных видов микроорганизмов, постоянно обитающих на коже человека, — многообразная и многоуровневая система.

Стафилококки вида Staphylococcus epidermidis являются представителями флоры кожи здоровых людей, тогда как Staphylococcus aureus и Staphylococcus haemolyticus обнаруживаются у большинства носителей с различными воспалительными заболеваниями кожного покрова (дерматозами). В некотором количестве они могут присутствовать и в норме, поэтому количество, или обсемененность, данных бактерий также имеет значение.

Пропионобактерии являются наиболее многочисленными обитателями кожи. Считают, что на коже человека обитают в основном виды P. acne, P. granulosum и P. avidum. Количественный учет пропионовых бактерий осложняется тем, что они способны к быстрому росту в виде агломератов, т.е. больших групп микроорганизмов, объединенных в одну крупную колонию. Учет обсемененности кожи человека очень важен для оценки взаимосвязи между наличием патологического процесса и определенным видом пропионовых бактерий.

Если иммунитет человека по каким-либо причинам снижается или на кожу воздействуют травмирующие факторы (травмы, ожоги и пр.), численность грибов рода Malassezia значительно возрастает. При ряде дерматозов численность дрожжей рода Malassezia увеличивается по сравнению с нормой, в то время как видовой состав этих микроорганизмов практически не связан с патологией. Наиболее распространенный вид — Malassezia sympodialis.

Анализ микробиоты кожи по Осипову позволяет выявить состав микроорганизмов, обитающих на коже человека быстро и с высокой точностью. В основе метода лежит хромато-масс-спектрометрия.

Отличительная особенность метода — высокая эффективность разделения, чувствительность до микро- и нанограмм, а также быстрота выполнения анализа.

Определение микробиоценоза кожи по Осипову позволяет:

Благодаря данному анализу специалист может определить какая флора преобладает на коже пациента, обнаружить микробный дисбаланс и назначить подходящую терапию, чтобы восстановить равновесие.

В качестве исследуемого материала используют соскоб с поверхности кожи (в него в результате входят кожные чешуйки, кожное сало).

В результатах исследования указывают количество и виды выявленных микроорганизмов. Полученные результаты пациент передает врачу, который поставит соответствующий диагноз и в случае необходимости назначит лечение.

Источник

Связь микробиоты уретры с качеством эякулята и содержанием эндокринных дисрапторов в семенной жидкости у мужчин

1 ФГБОУ ВО «Южно-Уральский государственный медицинский университет» Минздрава России; Россия, 454092 Челябинск, ул. Воровского, 64;
2 ООО «ДНК клиника»; Россия, 454048 Челябинск, ул. Яблочкина, 3

Введение

Бесплодие – важная медико-социальная проблема. Известно, что мужской фактор (патозооспермия – нарушение качества эякулята) выявляют примерно в 50 % бесплодных пар, причем на долю идиопатической формы мужского бесплодия приходится не менее 30 %, а доля бессимптомной урогенитальной инфекции, по данным E. Nieschlag [1], составляет 8 %. Среди вероятных причин идиопатической формы бесплодия рассматриваются: генетические факторы, воздействие активных форм кислорода и эндокринных дисрапторов [1].

Связь условно-патогенной урогенитальной инфекции с качеством эякулята широко изучается в настоящее время с помощью полимеразной цепной реакции, хроматографии с масс-спектрометрией или высокопроизводительного секвенирования (next-generation sequencing) [2–4]. Хорошо известна роль условно-патогенных микроорганизмов в метаболизме ксенобиотиков [5, 6], а также их способность вызывать гибель клеток, в частности апоптоз сперматозоидов [7–9]. Вместе с тем отсутствуют убедительные данные о том, при каких условиях условно-патогенная микрофлора урогенитального тракта способна оказывать влияние на качество эякулята и становиться причиной мужской субфертильности или инфертильности.

Влияние на качество эякулята убиквитарных эндокринных дисрапторов, к которым относятся бисфенол А и триклозан, активно обсуждается в научной литературе [10–12]. Однако нам не встретились публикации, посвященные изучению связи между микробиотой урогенитального тракта, эндокринными дисрапторами и фертильностью мужчины.

Цель исследования – установить связь между наличием условно-патогенных микроорганизмов уретры и качеством эякулята, а также концентрацией убиквитарных эндокринных дисрапторов (бисфенола А и триклозана) в семенной жидкости.

Материалы и методы

С октября 2017 г. по сентябрь 2018 г. на базе «ДНК клиники» (Челябинск) проведено обсервационное одноцентровое одномоментное (поперечное) неконтролируемое исследование с участием 63 мужчин. Пациенты обратились в клинику для выполнения спермиологического анализа по поводу бесплодия в браке, невынашивания беременности партнершей, а также для планирования беременности или донорства спермы. Все пациенты были жителями Челябинска или Челябинской области

Критерии включения в исследование: мужской пол, возраст 20–40 лет, наличие идиопатической формы бесплодия, наличие репродуктивных потерь у супружеских пар с патозооспермией, бессимптомный дисбиоз уретры, планирование беременности супружескими парами с нормозооспермией, участие в донорстве спермы, информированное добровольное согласие на включение в исследование.

Критерии исключения из исследования: варикоцеле, инфекционно-воспалительные заболевания урогенитального тракта, вызванные патогенными и/или условно-патогенными микроорганизмами, лейкоспермия, MAR-тест >10 % по данным спермограммы, азооспермия, гипогонадизм и другие эндокринные заболевания, онкологические заболевания любой локализации, ВИЧ-инфекция, системные заболевания, отсутствие информированного добровольного согласия на включение в исследование.

Проводили лабораторное исследование эякулята и содержимого уретры. Эякулят собирали после 3–4 дней воздержания от семяизвержений. Забор содержимого уретры для исследования на наличие инфекции и воспаления осуществляли не менее чем через 3 ч после последнего мочеиспускания. Для исключения патологий органов мошонки (варикоцеле и др.) выполняли ультразвуковое исследование органов мошонки на аппарате Mindray DC-7 (Китай) в положении пациента лежа и стоя во время андрологического приема.

У всех пациентов проведено спермиологическое исследование с оценкой общего количества, концентрации, подвижности, морфологии сперматозоидов по Крюгеру. Спермиологическое исследование выполняли в соответствии с рекомендациями Всемирной организации здравоохранения (2010) [13]. Заключение о наличии нормозооспермии или патозооспермии основывали на критериях, изложенных в тех же рекомендациях [13].

По результатам оценки качества 63 образцов эякулята мужчины были распределены по 2 группам: в 1-ю вошли пациенты с нормозооспермией (n = 27), во 2-ю – с патозооспермией (n = 36).

Содержимое уретры исследовали методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием тест-системы «Андрофлор». Тестсистема «Андрофлор» позволила сформировать 3 кластера микроорганизмов:

Haemophilus spp., Pseudomonas aeruginosa/Ralstonia spp./ Burkholderia spp., Enterobacteriaceae spp./Enterococcus spp., а также Candida spp. ввиду их малочисленности в изучаемых образцах не позволили сформировать отдельный кластер и поэтому в статистический анализ не вошли.

Концентрацию бисфенола А и триклозана в семенной жидкости определяли на газовом хроматографе с масс-спектрометром Shimadzu GCMS-QP2010 Ultra (Shimadzu Corporation, Япония). Данные обрабатывали с помощью программы GCMSsolution 4.3 (Shimadzu Corporation, Япония).

Результаты

Среди 63 пациентов, которые приняли участие в исследовании, было 27 (42,9 %) мужчин с нормозооспермией (планирующих беременность в браке или доноров спермы) и 36 (57,1 %) мужчин с идиопатической формой бесплодия и/или репродуктивными потерями в супружеской паре с различными вариантами патозооспермии: тератозооспермией – в 18 (50 %) случаях, астенотератозооспермией – в 12 (33,3 %), олиготератозооспермией – в 4 (11,1 %), олигоастенотератозооспермией – в 2 (5,6 %).

В 100 % образцов эякулята был обнаружен бисфенол А с медианной концентрацией 0,150 (0,060– 0,310) нг/мл. Триклозан был выявлен в 84,9 % образцов эякулята с медианной концентрацией 0,125 (0,050– 0,220) нг/мл.

Группы статистически значимо различались по концентрации бисфенола А (p 0,1), за исключением Atopobium cluster (p = 0,031), входившего во 2-й кластер.

Обращает на себя внимание тот факт, что у мужчин с патозооспермией частота выявления микробиоты 1-го кластера (Lactobacillus spp., Staphylococсus spp. и Corynebacterium spp.) была несколько выше, чем у мужчин с нормозооспермией. Микроорганизмы, включенные во 2-й кластер (Gardnerella vaginalis, Megasphaera spp./Veilonella/Dialister spp., Sneathia spp./Leptotrichia spp./Fusobacterium spp., Ureaplasma parvum, Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis и Atopobium cluster), встречались чаще у мужчин с нормозооспермией, тогда как микроорганизмы 3-го кластера (Anaerococcus spp., Bacteroides spp./Porphyromonas spp./ Prevotella spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp., Eubacterium spp.) несколько чаще встречались у мужчин с патозооспермией.

С помощью коэффициента ранговой корреляции Спирмена между концентрацией бисфенола A, триклозана в семенной жидкости и частотой выявления микроорганизмов в уретре у мужчин были обнаружены следующие статистически значимые корреляционные связи (табл. 2).

Таблица 2. Статистически значимые корреляционные связи между концентрацией бисфенола А, триклозана в семенной жидкости и обсемененностью уретры микроорганизмами

Обсуждение

В данном исследовании был использован метод полимеразной цепной реакции в режиме реального времени для характеристики разнообразия микробиоты уретры. Результаты показали отсутствие статистически значимых различий между группами мужчин с нормозооспермией и патозооспермией по составу микробиоты уретры. D. Hou и соавт. (2013) также не обнаружили статистически значимых различий при сравнении микробиоты у доноров спермы и бесплодных мужчин [14]. В их работе была выявлена отрицательная статистически значимая корреляция между качеством эякулята и наличием Anaerococcus, но в нашем исследовании Anaerococcus spp., наряду с другими анаэробными микроорганизмами (Bacteroides spp./Porphyromonas spp./Prevotella spp., Peptostreptococcus spp./Parvimonas spp., Eubacterium spp.), также встречался чаще у мужчин с патозооспермией, хотя связь и оказалась статистически незначимой. S.-L. Weng и соавт. [2] продемонстрировали положительную статистически значимую корреляцию качества эякулята с наличием Lactobacillus и Gardnerella vaginalis и отрицательную – с наличием Prevotella, что подтвердилось и в нашем исследовании. Из микроорганизмов, традиционно выявляемых в микробиоценозе влагалища, статистически значимо чаще в уретральном микробиоценозе у мужчин с нормозооспермией присутствовала Atopobium cluster.

Исходя из этого, следует предположить, что условно-патогенные микроорганизмы, ассоциированные с бактериальным вагинозом, можно рассматривать при дальнейшем изучении микробиоты урогенитального тракта у мужчин как биомаркеры хорошего качества эякулята, а условно-патогенные анаэробы – наоборот, как биомаркеры низкого качества эякулята. Вместе с тем в ходе исследования была обнаружена тенденция к повышению уровня общей бактериальной обсемененности уретры с сокращением ее видового разнообразия у мужчин с патозооспермией, что согласуется с данными других авторов [4]. В нашей работе впервые была описана статистически значимая связь между концентрацией бисфенола А, триклозана в семенной жидкости и характеристиками микробиоты уретры. В некоторых публикациях также было показано отрицательное влияние эндокринных дисрапторов на микробиоту организма человека [6, 15].

Заключение

В ходе исследования установлены статистически значимые различия в концентрации бисфенола А и триклозана в семенной жидкости у мужчин с нормо- и патозооспермией. Обнаружены статистически значимые положительные корреляции между концентрацией бисфенола А в семенной жидкости и наличием вмикробиоте уретры Lactobacillus spp. (r = 0,501, р = 0,003), Corynebacterium spp. (r = 0,425, р = 0,015), Anaerococcus spp. (r = 0,371, р = 0,045), Eubacterium spp. (r = 0,357, р = 0,037). В отношении концентрации триклозана в семенной жидкости были установлены 2 статистически значимые корреляции: с наличием Staphylococсus spp. (r = 0,392, р = 0,026) и Streptococcus spp. (r = –0,486, р = 0,005). Таким образом, метаболизм эндокринных дисрапторов, осуществляемый микробиотой, может сопровождаться дисбиозом урогенитального тракта – изменением количественного и качественного состава условно-патогенных микроорганизмов, что может приводить к ухудшению качества эякулята.

Литература

Статья опубликована в журнале «Андрология и генитальная хирургия» выпуск №4 2018, стр. 60-66

Источник